Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGP37231 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGP37231 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPARGP37231 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPARGP37231 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPARGP37231 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGP37231 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGP37231 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms