Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP62P37198 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP62P37198 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NUP62P37198 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NUP62P37198 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NUP62P37198 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NUP62P37198 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NUP62P37198 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms