Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT2P35908 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT2P35908 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT2P35908 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT2P35908 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT2P35908 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT2P35908 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT2P35908 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT2P35908 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT2P35908 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT2P35908 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT2P35908 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT2P35908 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT2P35908 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT2P35908 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT2P35908 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT2P35908 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT2P35908 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT2P35908 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT2P35908 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT2P35908 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT2P35908 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT2P35908 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT2P35908 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT2P35908 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT2P35908 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT2P35908 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT2P35908 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT2P35908 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT2P35908 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT2P35908 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT2P35908 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT2P35908 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT2P35908 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT2P35908 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT2P35908 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT2P35908 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT2P35908 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT2P35908 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT2P35908 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT2P35908 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT2P35908 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT2P35908 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT2P35908 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT2P35908 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT2P35908 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT2P35908 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT2P35908 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT2P35908 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT2P35908 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT2P35908 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT2P35908 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT2P35908 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT2P35908 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT2P35908 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT2P35908 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms