Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms