Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms