Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NF2P35240 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NF2P35240 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NF2P35240 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NF2P35240 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NF2P35240 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NF2P35240 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NF2P35240 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NF2P35240 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NF2P35240 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NF2P35240 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NF2P35240 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NF2P35240 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NF2P35240 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NF2P35240 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NF2P35240 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NF2P35240 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NF2P35240 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NF2P35240 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NF2P35240 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NF2P35240 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NF2P35240 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NF2P35240 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NF2P35240 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NF2P35240 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NF2P35240 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NF2P35240 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NF2P35240 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NF2P35240 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NF2P35240 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NF2P35240 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NF2P35240 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NF2P35240 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NF2P35240 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NF2P35240 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NF2P35240 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NF2P35240 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NF2P35240 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NF2P35240 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NF2P35240 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NF2P35240 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NF2P35240 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NF2P35240 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NF2P35240 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NF2P35240 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NF2P35240 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NF2P35240 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NF2P35240 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NF2P35240 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NF2P35240 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NF2P35240 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NF2P35240 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NF2P35240 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NF2P35240 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NF2P35240 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF2P35240 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF2P35240 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF2P35240 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF2P35240 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF2P35240 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NF2P35240 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF2P35240 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF2P35240 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF2P35240 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF2P35240 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF2P35240 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF2P35240 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF2P35240 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF2P35240 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF2P35240 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF2P35240 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF2P35240 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF2P35240 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF2P35240 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF2P35240 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NF2P35240 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NF2P35240 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NF2P35240 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NF2P35240 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NF2P35240 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NF2P35240 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NF2P35240 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NF2P35240 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NF2P35240 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NF2P35240 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NF2P35240 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NF2P35240 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NF2P35240 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NF2P35240 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NF2P35240 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NF2P35240 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NF2P35240 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NF2P35240 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NF2P35240 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NF2P35240 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NF2P35240 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NF2P35240 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NF2P35240 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NF2P35240 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NF2P35240 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms