Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCM5P33992 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCM5P33992 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCM5P33992 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM5P33992 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCM5P33992 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCM5P33992 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCM5P33992 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCM5P33992 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCM5P33992 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCM5P33992 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCM5P33992 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM5P33992 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM5P33992 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM5P33992 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM5P33992 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM5P33992 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM5P33992 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM5P33992 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM5P33992 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM5P33992 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM5P33992 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM5P33992 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM5P33992 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM5P33992 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM5P33992 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM5P33992 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM5P33992 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM5P33992 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM5P33992 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM5P33992 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM5P33992 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM5P33992 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM5P33992 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM5P33992 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM5P33992 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM5P33992 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM5P33992 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM5P33992 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM5P33992 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCM5P33992 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCM5P33992 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCM5P33992 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCM5P33992 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCM5P33992 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCM5P33992 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCM5P33992 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCM5P33992 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCM5P33992 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCM5P33992 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCM5P33992 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms