Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AL807752.1-201ENST00000395082 1322 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 SLC8A1-AS1-207ENST00000444629 935 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AL354872.2-201ENST00000607679 466 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AC245519.2-201ENST00000633673 475 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AL606490.5-201ENST00000413071 760 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AL590240.2-201ENST00000413370 894 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 RNASEH2B-AS1-201ENST00000454605 1007 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AC104116.1-201ENST00000504539 411 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AC106868.1-201ENST00000505272 992 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 IFNA13-202ENST00000610660 1539 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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