Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TSPOP30536 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TSPOP30536 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TSPOP30536 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TSPOP30536 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TSPOP30536 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TSPOP30536 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TSPOP30536 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TSPOP30536 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TSPOP30536 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TSPOP30536 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TSPOP30536 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TSPOP30536 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TSPOP30536 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TSPOP30536 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TSPOP30536 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms