Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC27P30260 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC27P30260 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC27P30260 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC27P30260 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC27P30260 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC27P30260 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC27P30260 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC27P30260 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC27P30260 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC27P30260 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC27P30260 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC27P30260 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC27P30260 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC27P30260 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC27P30260 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC27P30260 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC27P30260 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC27P30260 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC27P30260 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC27P30260 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC27P30260 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC27P30260 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC27P30260 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC27P30260 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC27P30260 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC27P30260 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC27P30260 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC27P30260 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC27P30260 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC27P30260 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC27P30260 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC27P30260 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC27P30260 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC27P30260 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC27P30260 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC27P30260 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC27P30260 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC27P30260 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC27P30260 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC27P30260 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC27P30260 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC27P30260 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC27P30260 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC27P30260 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC27P30260 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC27P30260 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC27P30260 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC27P30260 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC27P30260 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC27P30260 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC27P30260 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC27P30260 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC27P30260 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC27P30260 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC27P30260 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC27P30260 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC27P30260 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC27P30260 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC27P30260 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC27P30260 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC27P30260 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC27P30260 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC27P30260 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC27P30260 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC27P30260 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC27P30260 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC27P30260 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC27P30260 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC27P30260 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC27P30260 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC27P30260 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC27P30260 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC27P30260 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC27P30260 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC27P30260 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC27P30260 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC27P30260 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC27P30260 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC27P30260 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC27P30260 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC27P30260 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC27P30260 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC27P30260 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC27P30260 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC27P30260 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC27P30260 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC27P30260 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC27P30260 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC27P30260 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC27P30260 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC27P30260 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC27P30260 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC27P30260 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC27P30260 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC27P30260 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC27P30260 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC27P30260 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC27P30260 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC27P30260 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms