Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTGFP29279 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTGFP29279 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTGFP29279 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTGFP29279 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTGFP29279 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTGFP29279 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTGFP29279 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTGFP29279 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTGFP29279 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTGFP29279 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTGFP29279 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTGFP29279 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTGFP29279 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTGFP29279 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTGFP29279 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTGFP29279 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTGFP29279 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTGFP29279 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTGFP29279 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTGFP29279 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTGFP29279 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTGFP29279 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTGFP29279 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTGFP29279 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTGFP29279 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTGFP29279 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTGFP29279 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTGFP29279 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTGFP29279 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTGFP29279 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTGFP29279 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTGFP29279 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTGFP29279 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTGFP29279 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTGFP29279 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTGFP29279 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTGFP29279 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTGFP29279 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTGFP29279 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTGFP29279 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTGFP29279 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTGFP29279 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTGFP29279 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTGFP29279 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTGFP29279 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTGFP29279 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTGFP29279 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTGFP29279 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTGFP29279 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTGFP29279 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTGFP29279 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTGFP29279 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTGFP29279 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTGFP29279 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTGFP29279 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTGFP29279 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTGFP29279 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTGFP29279 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTGFP29279 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTGFP29279 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTGFP29279 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTGFP29279 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTGFP29279 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTGFP29279 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTGFP29279 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTGFP29279 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms