Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD247P20963 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD247P20963 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD247P20963 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD247P20963 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD247P20963 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD247P20963 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD247P20963 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD247P20963 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD247P20963 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD247P20963 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD247P20963 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CD247P20963 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD247P20963 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD247P20963 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CD247P20963 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CD247P20963 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD247P20963 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD247P20963 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CD247P20963 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD247P20963 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD247P20963 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD247P20963 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD247P20963 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD247P20963 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD247P20963 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD247P20963 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD247P20963 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD247P20963 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD247P20963 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD247P20963 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD247P20963 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD247P20963 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD247P20963 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD247P20963 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD247P20963 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD247P20963 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD247P20963 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD247P20963 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD247P20963 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD247P20963 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD247P20963 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD247P20963 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD247P20963 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD247P20963 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD247P20963 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD247P20963 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD247P20963 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD247P20963 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD247P20963 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CD247P20963 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms