Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms