Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms