Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGCP20142 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGCP20142 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGCP20142 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PGCP20142 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGCP20142 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGCP20142 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGCP20142 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGCP20142 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGCP20142 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGCP20142 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGCP20142 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGCP20142 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGCP20142 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGCP20142 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PGCP20142 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGCP20142 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PGCP20142 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PGCP20142 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PGCP20142 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PGCP20142 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PGCP20142 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGCP20142 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms