Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CD53P19397 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD53P19397 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD53P19397 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD53P19397 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD53P19397 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD53P19397 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms