Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNB3P16520 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNB3P16520 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNB3P16520 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNB3P16520 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNB3P16520 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNB3P16520 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNB3P16520 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNB3P16520 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNB3P16520 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB3P16520 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB3P16520 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB3P16520 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB3P16520 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB3P16520 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB3P16520 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB3P16520 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms