Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSP16219 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSP16219 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSP16219 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSP16219 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSP16219 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSP16219 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSP16219 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSP16219 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSP16219 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSP16219 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ACADSP16219 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ACADSP16219 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ACADSP16219 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ACADSP16219 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ACADSP16219 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ACADSP16219 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSP16219 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSP16219 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSP16219 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSP16219 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSP16219 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSP16219 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSP16219 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSP16219 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSP16219 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSP16219 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSP16219 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSP16219 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSP16219 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSP16219 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSP16219 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSP16219 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSP16219 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSP16219 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSP16219 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSP16219 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSP16219 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSP16219 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSP16219 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSP16219 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSP16219 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACADSP16219 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms