Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms