Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms