Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR2C1P13056 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms