Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RARBP10826 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RARBP10826 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RARBP10826 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RARBP10826 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RARBP10826 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RARBP10826 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RARBP10826 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RARBP10826 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RARBP10826 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RARBP10826 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RARBP10826 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RARBP10826 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RARBP10826 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RARBP10826 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RARBP10826 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RARBP10826 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RARBP10826 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RARBP10826 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RARBP10826 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RARBP10826 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RARBP10826 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RARBP10826 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RARBP10826 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RARBP10826 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RARBP10826 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RARBP10826 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RARBP10826 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RARBP10826 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RARBP10826 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RARBP10826 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RARBP10826 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RARBP10826 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RARBP10826 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RARBP10826 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RARBP10826 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RARBP10826 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARBP10826 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARBP10826 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARBP10826 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARBP10826 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARBP10826 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARBP10826 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARBP10826 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RARBP10826 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARBP10826 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARBP10826 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARBP10826 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARBP10826 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RARBP10826 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms