Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI4P10075 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI4P10075 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI4P10075 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI4P10075 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI4P10075 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI4P10075 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI4P10075 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI4P10075 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI4P10075 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI4P10075 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI4P10075 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI4P10075 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI4P10075 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI4P10075 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI4P10075 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI4P10075 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI4P10075 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI4P10075 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI4P10075 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI4P10075 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GLI4P10075 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms