Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C4AP0C0L4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms