Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CBX7O95931 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CBX7O95931 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CBX7O95931 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms