Protein–RNA interactions for Protein: O75446

SAP30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30O75446 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAP30O75446 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAP30O75446 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAP30O75446 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAP30O75446 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAP30O75446 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SAP30O75446 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAP30O75446 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAP30O75446 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SAP30O75446 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAP30O75446 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAP30O75446 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAP30O75446 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms