Protein–RNA interactions for Protein: O75380

NDUFS6, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS6O75380 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS6O75380 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms