Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC38.71■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC38.7■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
ABCC9O60706 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms