Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYTH3O43739 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms