Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms