Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP3O14828 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAMP3O14828 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAMP3O14828 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAMP3O14828 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAMP3O14828 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAMP3O14828 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAMP3O14828 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAMP3O14828 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAMP3O14828 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAMP3O14828 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms