Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F3O00716 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F3O00716 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F3O00716 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F3O00716 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F3O00716 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F3O00716 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F3O00716 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F3O00716 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F3O00716 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F3O00716 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms