Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms