Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC69A6NI79 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms