Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms