Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms