Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 SSPN-202ENST00000422622 4348 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 KIF6-208ENST00000538893 2386 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 RIT1-202ENST00000368323 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 HAPLN1-201ENST00000274341 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 EIF1AD-204ENST00000526451 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 ATP8B5P-202ENST00000423138 2157 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 SH3GL2-201ENST00000380607 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 LRRC4C-202ENST00000527150 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 NEFM-202ENST00000433454 2519 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 AL031594.1-201ENST00000417123 1932 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 ACAA2-206ENST00000589432 1840 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 ERVFRD-1-202ENST00000542862 3184 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 CNTN2-212ENST00000638378 4447 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 PNPLA8-203ENST00000422087 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 DDHD1-203ENST00000395606 12769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 CSF3R-203ENST00000373103 3454 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 CECR2-201ENST00000262608 4783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 SIRPB1-213ENST00000568365 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 PIGR-201ENST00000356495 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 AC136628.1-201ENST00000503218 561 ntTSL 4 BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 AC124290.2-201ENST00000519431 286 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 AP003170.1-201ENST00000536944 1030 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 AL109628.2-201ENST00000554037 201 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 MIR3650-201ENST00000581972 60 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 LINC01927-201ENST00000582231 712 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 ZNF222-203ENST00000587846 537 ntTSL 4 BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
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HOXD11P31277 AKAP12-202ENST00000354675 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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HOXD11P31277 ZBTB20-203ENST00000462705 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
HOXD11P31277 XRCC6-204ENST00000405506 1958 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 SALL1-201ENST00000251020 5146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
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HOXD11P31277 FANCM-202ENST00000542564 6167 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 RUFY2-213ENST00000602465 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
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HOXD11P31277 LINC00608-201ENST00000419101 2254 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
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HOXD11P31277 CSTL1-201ENST00000246020 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 AL136968.1-201ENST00000403053 946 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 IGLC6-201ENST00000410078 317 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 AL353754.1-201ENST00000440219 340 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 AC022880.2-201ENST00000532664 270 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 FAM229B-202ENST00000604268 598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 AC141557.2-201ENST00000621330 482 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 MXRA5-201ENST00000217939 9793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 ZNF577-201ENST00000301399 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 SLC8A1-202ENST00000402441 3065 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 DENND5B-203ENST00000536562 4291 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 PDPN-212ENST00000621990 2738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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