Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 ZNF396-201ENST00000306346 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 ZNF195-203ENST00000343338 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 DCAF1-202ENST00000423656 5946 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
TRHP20396 NEMP1-202ENST00000379391 5370 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TRHP20396 GRIA2-201ENST00000264426 3445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
TRHP20396 NAA16-201ENST00000379406 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC016152.1-201ENST00000548344 521 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 PIWIL3-204ENST00000533313 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 TNR-202ENST00000367674 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 AMMECR1L-201ENST00000272647 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 DNAH9-215ENST00000608377 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 MYO5C-201ENST00000261839 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 LIMCH1-215ENST00000512632 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 GPATCH11-202ENST00000409774 3906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRHP20396 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 DNAH9-201ENST00000262442 13750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 EPHB2-201ENST00000374627 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 RPGR-201ENST00000318842 3108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 CRNKL1-201ENST00000377327 4370 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 BBS9-204ENST00000396127 3914 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 ERG-206ENST00000398911 4914 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 AL353052.2-201ENST00000441459 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 C2CD3-202ENST00000334126 7960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 ADIPOQ-AS1-201ENST00000422718 3443 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 ADGRE1-204ENST00000381407 2687 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 KIF15-201ENST00000326047 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 OR1D2-202ENST00000641064 4882 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 GRAMD2B-212ENST00000513040 2196 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 TACC2-207ENST00000369000 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 SLC24A1-203ENST00000399033 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TRHP20396 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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