Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 THNSL1-202ENST00000524413 3788 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 C4BPB-201ENST00000243611 1117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LEMD1-201ENST00000367149 604 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LEMD1-202ENST00000367151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL353662.2-201ENST00000372214 645 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 SNORA10B-201ENST00000384458 133 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 SNORA74B-201ENST00000391100 201 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LEMD1-206ENST00000391936 727 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP26-201ENST00000410247 293 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 IFNA12P-201ENST00000413147 571 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL117378.1-202ENST00000421310 601 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 VNN3-208ENST00000427187 1214 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 FAM136BP-201ENST00000428729 417 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MIATNB-204ENST00000437071 1006 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RBMY2OP-201ENST00000447105 810 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC009411.2-201ENST00000458359 539 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ABRACL-202ENST00000461027 456 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RN7SL156P-201ENST00000480334 304 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 SNRPD2P1-201ENST00000489253 354 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 TRMT112P1-201ENST00000505515 351 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 PPIAP11-201ENST00000510729 493 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC012613.1-202ENST00000512647 424 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AP003721.2-201ENST00000536495 452 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC109460.4-201ENST00000561471 454 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC063923.2-201ENST00000562158 928 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC034105.5-201ENST00000564017 314 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC010542.5-201ENST00000612427 382 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC131159.2-201ENST00000613236 702 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RPL17-224ENST00000618619 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 PTP4A1-206ENST00000627002 447 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 VIPR1-AS1-229ENST00000628282 515 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 GNPDA2-201ENST00000295448 1930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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