Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 LIMS1-203ENST00000393310 4392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 PAX6-231ENST00000606377 6901 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 AL049697.1-201ENST00000507897 2301 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 MPP7-203ENST00000375732 5063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 TENM3-204ENST00000511685 10896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 ACAN-201ENST00000352105 7526 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 DPYSL2-201ENST00000311151 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 AL133216.2-201ENST00000622550 7213 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 AGPAT4-203ENST00000366911 7705 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 ITGA11-202ENST00000423218 10192 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 DMXL2-201ENST00000251076 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF626-203ENST00000601440 5963 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 PLEKHA5-213ENST00000538714 6487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 MXRA5-201ENST00000217939 9793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 LRRC37A2-203ENST00000576629 5669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 MYO6-203ENST00000369981 8692 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 NRP1-206ENST00000374867 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 LUZP1-202ENST00000314174 3715 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 NSD2-207ENST00000398261 8390 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 GUCY1A2-203ENST00000526355 16205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 NCOA1-204ENST00000405141 7405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 MYOM1-203ENST00000400569 4927 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 DAZ1-202ENST00000405239 4421 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 PRPF8-201ENST00000304992 7295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 CHRDL1-201ENST00000372042 1934 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF286B-201ENST00000285274 5145 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 HERC3-202ENST00000402738 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP21-2Q3LI59 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms