Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC005518.2-201ENST00000603254 282 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AKAP7-202ENST00000342266 2461 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC127502.2-201ENST00000602663 2351 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC016582.1-202ENST00000636341 2982 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 GABRP-203ENST00000518525 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 NLRP9-201ENST00000332836 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ZNF45-204ENST00000589703 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ESRP1-202ENST00000423620 3746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 LINC02159-202ENST00000518580 2323 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ZNF502-201ENST00000296091 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC024257.1-201ENST00000547523 566 ntTSL 4 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 LRP1-AS-201ENST00000554476 325 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC005841.2-201ENST00000637658 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AL022163.1-201ENST00000430261 1569 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RNPC3-208ENST00000533099 3641 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ETS1-204ENST00000526145 3389 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC069222.1-201ENST00000608028 3360 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 GOSR2-238ENST00000640495 3395 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 OR2H2-202ENST00000641840 3061 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AL133467.3-203ENST00000461160 3574 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ALG13-201ENST00000251943 3997 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ZNF200-203ENST00000396871 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 TLR3-202ENST00000504367 2310 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
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