Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ARMC3-201ENST00000298032 2811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 YME1L1-203ENST00000376016 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CXCR6-201ENST00000304552 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AMMECR1L-201ENST00000272647 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 GART-201ENST00000361093 2149 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 KIAA1328-207ENST00000591619 5881 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 FAM26E-201ENST00000368599 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ELF4-202ENST00000335997 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ICA1L-202ENST00000392237 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 PSG5-202ENST00000366175 1766 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 WIPF3-203ENST00000409290 4002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 JADE1-202ENST00000413543 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ZNF322-201ENST00000415922 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 SELENON-205ENST00000630065 2994 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC008543.1-201ENST00000344893 3383 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 SNTG1-207ENST00000522124 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 PCDH19-203ENST00000420881 7936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 MUC1-209ENST00000368396 516 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RPL7P17-201ENST00000470927 724 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RACK1-211ENST00000504726 388 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 IGLV3-7-201ENST00000522952 271 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC022239.1-201ENST00000527922 435 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 SLC5A4P1-201ENST00000532944 612 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RN7SL246P-201ENST00000584467 296 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC174071.1-201ENST00000603069 517 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL355987.5-201ENST00000621585 411 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 LINC00604-202ENST00000637924 684 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 NF1P1-201ENST00000604105 2645 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 LNX1-201ENST00000263925 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 SERPINA9-203ENST00000380365 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 OR1L8-202ENST00000641027 2024 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 TANC1-201ENST00000263635 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CPB1-208ENST00000491148 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 LINC01695-203ENST00000453420 4486 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ABCB1-211ENST00000622132 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 NCEH1-206ENST00000543711 4062 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 MCC-209ENST00000515367 3844 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 KEL-201ENST00000355265 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC012513.3-201ENST00000623250 2116 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ADH7-201ENST00000209665 2289 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 PSMC2-201ENST00000292644 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 TMEM236-201ENST00000377495 5464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 LYPLA2P3-201ENST00000417429 576 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 TRIM2-207ENST00000482578 773 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC244196.5-201ENST00000617347 406 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 APOL3-202ENST00000361710 3563 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ZNF221-201ENST00000251269 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC019155.2-201ENST00000420224 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 OR4K17-202ENST00000641386 4886 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ZNF169-203ENST00000480716 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 NELL2-202ENST00000395487 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 CCR4-201ENST00000330953 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 GBP7-201ENST00000294671 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 CEP68-205ENST00000537589 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 LINC02436-202ENST00000509017 2186 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AL391095.1-201ENST00000422519 2004 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 GINS4-209ENST00000523277 3873 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 PSEN1-205ENST00000406768 4062 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms