Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms