Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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