Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GK-207ENST00000427190 4573 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 P2RX6-202ENST00000413302 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFAF5-202ENST00000378106 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ADD2-205ENST00000413157 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXL2-216ENST00000484457 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SH2D4B-201ENST00000313455 2889 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 URM1-204ENST00000452446 2944 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN5A-207ENST00000449557 5898 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CNIH4-202ENST00000366857 3963 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH8-211ENST00000584337 3986 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXL17-206ENST00000619412 4059 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH18-202ENST00000382275 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC4C-202ENST00000527150 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GABBR1-203ENST00000377012 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SETD7-207ENST00000608958 5281 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PACSIN1-202ENST00000374043 4229 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RUNX1T1-227ENST00000520724 2103 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFAT-201ENST00000377838 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CBL-203ENST00000634586 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KY-201ENST00000423778 2345 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LILRA1-202ENST00000453777 2313 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MATR3-201ENST00000394805 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AJ239328.1-201ENST00000626237 4807 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM8-201ENST00000286096 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV1-50-201ENST00000390291 405 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TRBV7-7-201ENST00000390377 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFA3-202ENST00000391762 435 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 S100A13-202ENST00000392622 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CYTH4-202ENST00000402997 633 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LYG2-202ENST00000409238 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073957.1-201ENST00000418941 535 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 Z83851.1-201ENST00000420096 545 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PHBP11-201ENST00000420550 809 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 HUNK-AS1-201ENST00000437109 616 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL663070.1-201ENST00000438210 725 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM91-206ENST00000447302 721 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS18P13-201ENST00000461260 454 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068298.1-201ENST00000465165 161 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK2AP2P2-201ENST00000478512 367 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC146949.1-201ENST00000505946 423 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC146944.1-201ENST00000508439 418 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GUSBP3-201ENST00000509348 423 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138956.2-201ENST00000512934 528 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms