Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 LINC02124-201ENST00000570087 484 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC005758.1-201ENST00000586408 625 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC009502.1-202ENST00000606673 602 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 TEX46-203ENST00000622840 479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC087645.3-201ENST00000624708 587 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC009053.1-202ENST00000563377 2051 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 SYNPR-201ENST00000295894 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 SLAMF7-211ENST00000621377 2608 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 C2CD3-201ENST00000313663 6283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 OR4F15-201ENST00000332238 2119 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 SAMD8-201ENST00000372687 6935 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 USP17L15-202ENST00000621432 1680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ZNF343-208ENST00000617391 3300 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 PTPRA-204ENST00000380393 3636 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 TCF4-246ENST00000570287 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CDKL5-209ENST00000635828 3823 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 PTPRB-201ENST00000261266 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 POGZ-203ENST00000368863 6054 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 OR7A17-201ENST00000327462 1127 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 MIR185-201ENST00000385288 82 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC007036.1-201ENST00000430537 674 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC016734.1-201ENST00000436998 654 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL161454.1-201ENST00000446226 569 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC239798.1-201ENST00000449024 1176 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC018816.1-206ENST00000474544 455 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RN7SL448P-201ENST00000475566 295 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RPS10P16-201ENST00000483812 496 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RN7SL135P-201ENST00000490144 278 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC073896.5-201ENST00000546464 542 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC005632.1-201ENST00000550637 576 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 NAPA-AS1-202ENST00000594367 630 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC233702.11-201ENST00000598588 333 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC040978.1-201ENST00000617244 1282 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CPSF7-226ENST00000626926 306 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CTNND1-208ENST00000428599 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 NBPF19-202ENST00000426482 2344 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 PECAM1-203ENST00000563924 6831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 URM1-202ENST00000372850 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CNPY1-201ENST00000321736 2378 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 GBP4-201ENST00000355754 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC108058.1-201ENST00000457290 2044 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 TMPRSS4-219ENST00000616579 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 MASP1-202ENST00000296280 4015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 LINC00672-201ENST00000583195 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC068733.1-202ENST00000531479 2456 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC092279.2-201ENST00000623742 2189 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ZBTB21-203ENST00000398499 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RRP8-201ENST00000254605 6560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL513302.1-201ENST00000415679 428 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CFL1P7-201ENST00000424759 486 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 MYL6BP1-201ENST00000429485 615 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL512649.2-201ENST00000446206 597 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RPSAP64-201ENST00000451820 336 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 SPATA24-203ENST00000451821 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AP000757.1-202ENST00000525260 891 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RN7SL796P-201ENST00000613991 291 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.211-201ENST00000635920 276 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AP001528.3-201ENST00000624364 3249 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 FAM205BP-202ENST00000399773 4009 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ERCC6-208ENST00000515869 3439 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 TRPM3-204ENST00000360823 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CLOCK-202ENST00000381322 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 R3HDM2-207ENST00000441731 4076 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 METTL7A-203ENST00000548553 4076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 SCRN3-201ENST00000272732 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 TTC33-201ENST00000337702 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 HIP1-201ENST00000336926 8013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms