Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02439-201ENST00000538783 450 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP2-1-202ENST00000542137 375 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC026254.3-201ENST00000584490 322 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A1P5-201ENST00000587610 783 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL23AP77-201ENST00000588044 463 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC020663.1-201ENST00000588099 556 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF544-203ENST00000594384 588 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092329.1-201ENST00000594653 574 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CNFN-202ENST00000597255 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.82-201ENST00000611637 265 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP10-9-203ENST00000616529 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL117190.3-201ENST00000621821 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC244230.1-201ENST00000623463 498 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PASK-216ENST00000629419 216 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PRSS2-205ENST00000632998 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SORCS1-203ENST00000369698 2638 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DGKA-229ENST00000551156 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PIGN-221ENST00000638183 4046 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DCLK3-203ENST00000636136 5446 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SIK2-201ENST00000304987 9678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SMG6-202ENST00000354901 3473 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX16-203ENST00000396330 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MYRFL-203ENST00000547771 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FER1L5-206ENST00000624922 6367 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PELO-201ENST00000274311 4349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR70-201ENST00000265107 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF776-201ENST00000317178 5292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SV2C-201ENST00000322285 3010 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GJB2-202ENST00000382848 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RP2-201ENST00000218340 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF4E3-205ENST00000448225 6209 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC245177.1-201ENST00000375625 2369 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC239585.1-201ENST00000375644 2369 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF708-201ENST00000356929 4004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PFKM-203ENST00000359794 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR2J4-202ENST00000427076 6466 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CDC14A-201ENST00000336454 4137 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TECTA-202ENST00000392793 7426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NAP1L3-202ENST00000475430 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM172A-201ENST00000395965 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CHAF1B-201ENST00000314103 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.2 ms