Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms