Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 MAP3K20-208ENST00000539448 2312 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 ASAH1-203ENST00000381733 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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