Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms